Директор - Амелина Елена Николаевна, действует в соответствии с законодательством РФ, Краснодарского края, Уставом МО Славянский район, уставом школы и трудовым договором.
Права и обязанности директора Учреждения, его компетенция в области управления Учреждением, порядок его назначения, срок полномочий: см. Устав п.36
Заместитель директора по учебно - воспитательной работе - Назаренко Наталья Витальевна
Заместитель директора по воспитательной работе - Долгополая Виктория Юрьевна
Заместитель директора по административно - хозяйственной работе - Бугаева Наталья Борисовна
Советник директора по воспитанию и взаимодействию с детскими общественными объединениями - Щербак Ольга Юрьевна
Социальный педагог - Егорова Анна Александровна
Педагог-психолог - Остроухих Дарья Андреевна
ПЕДАГОГИЧЕСКИЙ СОВЕТ - педагоги школы под председательством директора, заседания - по мере необходимости, но не реже четырёх раз в год
Компетенция педагогического совета, порядок его формирования, срок полномочий и порядок деятельности: см. Устав п.38
ОБЩЕЕ СОБРАНИЕ РАБОТНИКОВ УЧРЕЖДЕНИЯ – все члены трудового коллектива, заседания - по мере необходимости, но не реже 2 раз в год
Компетенция общего собрания работников Учреждения, порядок его формирования, срок полномочий и порядок деятельности: см. Устав п.37
АДМИНИСТРАТИВНЫЕ СОВЕЩАНИЯ –Амелина Елена Николаевна, Назаренко Наталья Витальевна, Долгополая Виктория Юрьевна
ШКОЛЬНОЕ САМОУПРАВЛЕНИЕ – атаман Казачьей Республики "Искра", ученик 8 класса Матвийченко Глеб Андреевич
Совет родителей – Чалкина Елена Владимировна
Совет обучающихся – Щербак Ольга Юрьевна
МЕТОДИЧЕСКИЙ СОВЕТ – Назаренко Наталья Витальевна
МЕТОДИЧЕСКОЕ ОБЪЕДИНЕНИЕ учителей - предметников - Ермоленко Наталья Петровна
МЕТОДИЧЕСКОЕ ОБЪЕДИНЕНИЕ учителей начальных классов – Завгородняя Лариса Григорьевна
МЕТОДИЧЕСКОЕ ОБЪЕДИНЕНИЕ классных руководителей - Долгополая Виктория Юрьевна
В СТРУКТУРЕ МБОУ ООШ № 46 ИМЕЮТСЯ ТАКЖЕ:
Библиотека - заведующая Гудым Инна Ивановна
Музейная комната - руководитель Гудым Инна Ивановна
Спортивный клуб "Олимп" - руководитель Драгун Александр Алексеевич, учитель физической культуры